中國科學院南京土壤研究所成立于1953年，其前身為1930年創立的中央地質調查所土壤研究室。作為中國土壤科學的發源地, 我所自成立以來一直肩負著為中國農業發展和生態環境建設服務的重任，凝聚和培養了一大批優秀人才，面向全國的土壤資源開展了一系列卓有成效的研究工作， 先后榮獲國家級科技獎勵50余項，省部級科技獎勵200余項，逐步發展成為在土壤科學領域研究實力雄厚、分支學科齊全并在國際上享有較高聲譽的國家級 土壤科學研究中心和高級人才培養基地，為我國乃至世界土壤科學的發展做出了重要貢獻。

自2001年實施知識創新工程以來,我所針對我國土壤資源利用、農業持續發展與生態環境建設中的國家需求，瞄準學科發展前沿，凝練了發展目標，優化了學科布局， 科技創新取得了全面成效。在土壤質量演變規律、水肥資源高效利用、土壤污染及修復、農村面源污染控制與治理、稻田生態系統對全球變化的貢獻及其響應、 人為活動對土壤資源利用的影響等領域做出了一批原創性的研究成果；在土壤質量表征與評價、土壤系統分類、可變電荷土壤特性、土壤圈物質循環與其它圈層的物質交換等 基礎研究方面取得顯著進展,國際學術地位顯著提高。研究所建立了適合現代研究所科技創新和發展的運行機制和創新文化氛圍，整體發展態勢良好。

目前，我所正緊密圍繞中國科學院“三個面向”“四個率先”新時期辦院方針，積極推動落實“率先行動”計劃和“一三五”規劃實施，聚焦重大創新目標和“三重大”產出要求，加快推動科技創新進入高質量發展階段，充分發揮我所在中國土壤科學領域的骨干引領和示范帶頭作用。在新的征程上，我們任重而道遠。在此，我謹向關心和支持南京土壤所發展的社會各界及海內外朋友表示誠摯的謝意！熱忱歡迎海內外優秀人才加入我們的行列，再創中國土壤科學事業的新輝煌！